Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYBBP04839 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYBBP04839 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYBBP04839 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYBBP04839 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYBBP04839 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYBBP04839 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CYBBP04839 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYBBP04839 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYBBP04839 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYBBP04839 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYBBP04839 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYBBP04839 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYBBP04839 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYBBP04839 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYBBP04839 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYBBP04839 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYBBP04839 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYBBP04839 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYBBP04839 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYBBP04839 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYBBP04839 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYBBP04839 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYBBP04839 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYBBP04839 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYBBP04839 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYBBP04839 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYBBP04839 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYBBP04839 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CYBBP04839 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYBBP04839 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CYBBP04839 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYBBP04839 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYBBP04839 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYBBP04839 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYBBP04839 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYBBP04839 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYBBP04839 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYBBP04839 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYBBP04839 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYBBP04839 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYBBP04839 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYBBP04839 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYBBP04839 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CYBBP04839 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYBBP04839 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CYBBP04839 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CYBBP04839 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CYBBP04839 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CYBBP04839 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYBBP04839 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CYBBP04839 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYBBP04839 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYBBP04839 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYBBP04839 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYBBP04839 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYBBP04839 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYBBP04839 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYBBP04839 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYBBP04839 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYBBP04839 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYBBP04839 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYBBP04839 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYBBP04839 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYBBP04839 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYBBP04839 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYBBP04839 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYBBP04839 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYBBP04839 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYBBP04839 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CYBBP04839 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CYBBP04839 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYBBP04839 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYBBP04839 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYBBP04839 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYBBP04839 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYBBP04839 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYBBP04839 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYBBP04839 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYBBP04839 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CYBBP04839 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CYBBP04839 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYBBP04839 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYBBP04839 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYBBP04839 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYBBP04839 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYBBP04839 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYBBP04839 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYBBP04839 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYBBP04839 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYBBP04839 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYBBP04839 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYBBP04839 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYBBP04839 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYBBP04839 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYBBP04839 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYBBP04839 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYBBP04839 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYBBP04839 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CYBBP04839 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms