Protein–RNA interactions for Protein: P01733

TRBV12-3, T-cell receptor beta chain V region YT35, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV12-3P01733 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TRBV12-3P01733 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TRBV12-3P01733 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
TRBV12-3P01733 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TRBV12-3P01733 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TRBV12-3P01733 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TRBV12-3P01733 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TRBV12-3P01733 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TRBV12-3P01733 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TRBV12-3P01733 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TRBV12-3P01733 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TRBV12-3P01733 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TRBV12-3P01733 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TRBV12-3P01733 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TRBV12-3P01733 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TRBV12-3P01733 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TRBV12-3P01733 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TRBV12-3P01733 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TRBV12-3P01733 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TRBV12-3P01733 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TRBV12-3P01733 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TRBV12-3P01733 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TRBV12-3P01733 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV12-3P01733 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV12-3P01733 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV12-3P01733 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV12-3P01733 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV12-3P01733 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV12-3P01733 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV12-3P01733 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV12-3P01733 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV12-3P01733 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV12-3P01733 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV12-3P01733 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV12-3P01733 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV12-3P01733 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV12-3P01733 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV12-3P01733 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV12-3P01733 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV12-3P01733 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV12-3P01733 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV12-3P01733 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV12-3P01733 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV12-3P01733 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV12-3P01733 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV12-3P01733 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV12-3P01733 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV12-3P01733 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV12-3P01733 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV12-3P01733 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV12-3P01733 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV12-3P01733 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV12-3P01733 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV12-3P01733 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV12-3P01733 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV12-3P01733 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV12-3P01733 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV12-3P01733 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV12-3P01733 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV12-3P01733 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV12-3P01733 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TRBV12-3P01733 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TRBV12-3P01733 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
TRBV12-3P01733 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TRBV12-3P01733 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TRBV12-3P01733 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TRBV12-3P01733 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TRBV12-3P01733 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
TRBV12-3P01733 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TRBV12-3P01733 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TRBV12-3P01733 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TRBV12-3P01733 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TRBV12-3P01733 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TRBV12-3P01733 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TRBV12-3P01733 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TRBV12-3P01733 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
TRBV12-3P01733 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TRBV12-3P01733 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TRBV12-3P01733 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
TRBV12-3P01733 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
TRBV12-3P01733 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TRBV12-3P01733 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TRBV12-3P01733 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
TRBV12-3P01733 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TRBV12-3P01733 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TRBV12-3P01733 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TRBV12-3P01733 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TRBV12-3P01733 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TRBV12-3P01733 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TRBV12-3P01733 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TRBV12-3P01733 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TRBV12-3P01733 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TRBV12-3P01733 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TRBV12-3P01733 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TRBV12-3P01733 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TRBV12-3P01733 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TRBV12-3P01733 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TRBV12-3P01733 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TRBV12-3P01733 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TRBV12-3P01733 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms