Protein–RNA interactions for Protein: O43345

ZNF208, Zinc finger protein 208, humanhuman

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Length 1,280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF208O43345 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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ZNF208O43345 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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ZNF208O43345 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
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ZNF208O43345 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
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ZNF208O43345 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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ZNF208O43345 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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ZNF208O43345 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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ZNF208O43345 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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ZNF208O43345 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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