Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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