Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms