Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.4 ms