Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TNFSF18Q9UNG2 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms