Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LHX3Q9UBR4 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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