Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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