Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

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Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
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CNTN3Q9P232 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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