Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HACD3Q9P035 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HACD3Q9P035 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HACD3Q9P035 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HACD3Q9P035 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HACD3Q9P035 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HACD3Q9P035 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HACD3Q9P035 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HACD3Q9P035 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HACD3Q9P035 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HACD3Q9P035 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HACD3Q9P035 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HACD3Q9P035 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HACD3Q9P035 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HACD3Q9P035 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HACD3Q9P035 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HACD3Q9P035 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HACD3Q9P035 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HACD3Q9P035 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HACD3Q9P035 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HACD3Q9P035 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HACD3Q9P035 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HACD3Q9P035 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HACD3Q9P035 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HACD3Q9P035 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HACD3Q9P035 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HACD3Q9P035 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HACD3Q9P035 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HACD3Q9P035 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HACD3Q9P035 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HACD3Q9P035 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HACD3Q9P035 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HACD3Q9P035 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HACD3Q9P035 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HACD3Q9P035 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
HACD3Q9P035 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HACD3Q9P035 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HACD3Q9P035 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HACD3Q9P035 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HACD3Q9P035 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HACD3Q9P035 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HACD3Q9P035 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HACD3Q9P035 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HACD3Q9P035 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HACD3Q9P035 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HACD3Q9P035 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HACD3Q9P035 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HACD3Q9P035 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HACD3Q9P035 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HACD3Q9P035 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HACD3Q9P035 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HACD3Q9P035 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HACD3Q9P035 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HACD3Q9P035 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HACD3Q9P035 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HACD3Q9P035 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HACD3Q9P035 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HACD3Q9P035 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HACD3Q9P035 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HACD3Q9P035 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HACD3Q9P035 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HACD3Q9P035 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HACD3Q9P035 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HACD3Q9P035 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HACD3Q9P035 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HACD3Q9P035 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HACD3Q9P035 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HACD3Q9P035 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HACD3Q9P035 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HACD3Q9P035 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HACD3Q9P035 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HACD3Q9P035 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HACD3Q9P035 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HACD3Q9P035 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HACD3Q9P035 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HACD3Q9P035 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HACD3Q9P035 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HACD3Q9P035 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HACD3Q9P035 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HACD3Q9P035 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HACD3Q9P035 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HACD3Q9P035 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HACD3Q9P035 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HACD3Q9P035 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HACD3Q9P035 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HACD3Q9P035 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HACD3Q9P035 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HACD3Q9P035 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HACD3Q9P035 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HACD3Q9P035 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HACD3Q9P035 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HACD3Q9P035 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HACD3Q9P035 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HACD3Q9P035 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HACD3Q9P035 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HACD3Q9P035 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HACD3Q9P035 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HACD3Q9P035 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HACD3Q9P035 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HACD3Q9P035 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms