Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN4

EHD2, EH domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD2Q9NZN4 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EHD2Q9NZN4 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms