Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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