Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms