Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms