Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
BHLHE41Q9C0J9 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms