Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms