Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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