Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms