Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms