Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms