Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MCOLN3Q8TDD5 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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