Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SPC24Q8NBT2 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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SPC24Q8NBT2 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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SPC24Q8NBT2 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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SPC24Q8NBT2 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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SPC24Q8NBT2 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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SPC24Q8NBT2 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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SPC24Q8NBT2 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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SPC24Q8NBT2 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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SPC24Q8NBT2 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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SPC24Q8NBT2 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPC24Q8NBT2 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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