Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNE4Q8N205 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SYNE4Q8N205 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNE4Q8N205 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNE4Q8N205 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNE4Q8N205 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNE4Q8N205 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNE4Q8N205 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNE4Q8N205 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNE4Q8N205 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNE4Q8N205 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNE4Q8N205 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNE4Q8N205 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNE4Q8N205 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNE4Q8N205 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNE4Q8N205 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms