Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms