Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRAMD4Q6IC98 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms