Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

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Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PRAMEF20Q5VT98 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PRAMEF20Q5VT98 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PRAMEF20Q5VT98 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PRAMEF20Q5VT98 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PRAMEF20Q5VT98 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PRAMEF20Q5VT98 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PRAMEF20Q5VT98 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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PRAMEF20Q5VT98 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PRAMEF20Q5VT98 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PRAMEF20Q5VT98 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PRAMEF20Q5VT98 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PRAMEF20Q5VT98 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PRAMEF20Q5VT98 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PRAMEF20Q5VT98 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PRAMEF20Q5VT98 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PRAMEF20Q5VT98 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PRAMEF20Q5VT98 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PRAMEF20Q5VT98 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PRAMEF20Q5VT98 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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PRAMEF20Q5VT98 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PRAMEF20Q5VT98 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PRAMEF20Q5VT98 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PRAMEF20Q5VT98 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PRAMEF20Q5VT98 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PRAMEF20Q5VT98 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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PRAMEF20Q5VT98 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PRAMEF20Q5VT98 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PRAMEF20Q5VT98 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PRAMEF20Q5VT98 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PRAMEF20Q5VT98 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PRAMEF20Q5VT98 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PRAMEF20Q5VT98 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PRAMEF20Q5VT98 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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PRAMEF20Q5VT98 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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PRAMEF20Q5VT98 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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PRAMEF20Q5VT98 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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PRAMEF20Q5VT98 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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