Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PDZK1Q5T2W1 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
PDZK1Q5T2W1 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PDZK1Q5T2W1 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PDZK1Q5T2W1 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PDZK1Q5T2W1 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PDZK1Q5T2W1 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
PDZK1Q5T2W1 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PDZK1Q5T2W1 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PDZK1Q5T2W1 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PDZK1Q5T2W1 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PDZK1Q5T2W1 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PDZK1Q5T2W1 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PDZK1Q5T2W1 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PDZK1Q5T2W1 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PDZK1Q5T2W1 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PDZK1Q5T2W1 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PDZK1Q5T2W1 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PDZK1Q5T2W1 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PDZK1Q5T2W1 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
PDZK1Q5T2W1 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PDZK1Q5T2W1 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PDZK1Q5T2W1 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PDZK1Q5T2W1 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PDZK1Q5T2W1 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PDZK1Q5T2W1 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PDZK1Q5T2W1 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDZK1Q5T2W1 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDZK1Q5T2W1 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDZK1Q5T2W1 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDZK1Q5T2W1 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDZK1Q5T2W1 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDZK1Q5T2W1 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDZK1Q5T2W1 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PDZK1Q5T2W1 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDZK1Q5T2W1 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDZK1Q5T2W1 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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PDZK1Q5T2W1 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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PDZK1Q5T2W1 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDZK1Q5T2W1 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDZK1Q5T2W1 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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PDZK1Q5T2W1 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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PDZK1Q5T2W1 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDZK1Q5T2W1 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDZK1Q5T2W1 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
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PDZK1Q5T2W1 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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PDZK1Q5T2W1 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PDZK1Q5T2W1 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDZK1Q5T2W1 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDZK1Q5T2W1 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDZK1Q5T2W1 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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