Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HSD17B12Q53GQ0 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HSD17B12Q53GQ0 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms