Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 DLG4-206ENST00000485100 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 ACER3-205ENST00000526597 1269 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 SRRM2-AS1-204ENST00000573802 818 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 THAP4-203ENST00000402545 833 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 AC013436.1-201ENST00000425077 422 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 AC011431.1-201ENST00000512971 230 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 AC011676.3-201ENST00000520606 294 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 RNASEH2CP1-201ENST00000454281 502 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 SAA1-202ENST00000405158 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 B9D1-206ENST00000461069 923 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 ALG1L15P-201ENST00000482834 794 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 AL513478.2-202ENST00000621949 835 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 Metazoa_SRP.156-201ENST00000622344 262 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 AC122694.1-201ENST00000510987 563 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 AC010478.1-203ENST00000558403 532 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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