Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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