Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FXNQ16595 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FXNQ16595 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FXNQ16595 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FXNQ16595 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
FXNQ16595 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FXNQ16595 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FXNQ16595 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FXNQ16595 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FXNQ16595 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FXNQ16595 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
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FXNQ16595 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FXNQ16595 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FXNQ16595 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
FXNQ16595 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FXNQ16595 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FXNQ16595 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
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FXNQ16595 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FXNQ16595 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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FXNQ16595 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FXNQ16595 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FXNQ16595 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FXNQ16595 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FXNQ16595 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FXNQ16595 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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FXNQ16595 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
FXNQ16595 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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FXNQ16595 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FXNQ16595 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FXNQ16595 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FXNQ16595 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FXNQ16595 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FXNQ16595 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FXNQ16595 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FXNQ16595 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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FXNQ16595 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FXNQ16595 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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FXNQ16595 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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FXNQ16595 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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FXNQ16595 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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FXNQ16595 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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FXNQ16595 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FXNQ16595 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FXNQ16595 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FXNQ16595 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FXNQ16595 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FXNQ16595 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FXNQ16595 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FXNQ16595 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FXNQ16595 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FXNQ16595 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FXNQ16595 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FXNQ16595 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FXNQ16595 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FXNQ16595 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FXNQ16595 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FXNQ16595 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FXNQ16595 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FXNQ16595 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FXNQ16595 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FXNQ16595 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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