Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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