Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms