Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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SYCP1Q15431 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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SYCP1Q15431 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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