Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
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