Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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RAB35Q15286 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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RAB35Q15286 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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RAB35Q15286 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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RAB35Q15286 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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RAB35Q15286 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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RAB35Q15286 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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RAB35Q15286 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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