Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC19.89■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NWD1Q149M9 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NWD1Q149M9 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NWD1Q149M9 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NWD1Q149M9 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NWD1Q149M9 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NWD1Q149M9 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NWD1Q149M9 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NWD1Q149M9 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NWD1Q149M9 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NWD1Q149M9 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NWD1Q149M9 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NWD1Q149M9 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NWD1Q149M9 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NWD1Q149M9 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NWD1Q149M9 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NWD1Q149M9 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NWD1Q149M9 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NWD1Q149M9 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NWD1Q149M9 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NWD1Q149M9 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NWD1Q149M9 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NWD1Q149M9 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NWD1Q149M9 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NWD1Q149M9 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NWD1Q149M9 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NWD1Q149M9 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NWD1Q149M9 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NWD1Q149M9 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NWD1Q149M9 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NWD1Q149M9 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NWD1Q149M9 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NWD1Q149M9 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NWD1Q149M9 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NWD1Q149M9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NWD1Q149M9 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NWD1Q149M9 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NWD1Q149M9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms