Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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PKP1Q13835 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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PKP1Q13835 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
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PKP1Q13835 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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PKP1Q13835 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
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PKP1Q13835 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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