Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms