Protein–RNA interactions for Protein: Q13636

RAB31, Ras-related protein Rab-31, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB31Q13636 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 MYO18B-202ENST00000407587 8090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 RALGPS1-201ENST00000259351 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 SRD5A1-201ENST00000274192 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 ZNF283-209ENST00000618787 5713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 IKZF1-211ENST00000440768 5511 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 ARSD-202ENST00000381154 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 MYH3-205ENST00000583535 6037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 PDE12-201ENST00000311180 8773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
RAB31Q13636 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
RAB31Q13636 UBN1-202ENST00000396658 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
RAB31Q13636 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RAB31Q13636 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RAB31Q13636 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RAB31Q13636 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RAB31Q13636 CACNA2D2-202ENST00000360963 5272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RAB31Q13636 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RAB31Q13636 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RAB31Q13636 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RAB31Q13636 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms