Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
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