Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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TOP3AQ13472 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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TOP3AQ13472 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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TOP3AQ13472 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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TOP3AQ13472 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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TOP3AQ13472 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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TOP3AQ13472 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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TOP3AQ13472 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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TOP3AQ13472 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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TOP3AQ13472 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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TOP3AQ13472 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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TOP3AQ13472 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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TOP3AQ13472 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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