Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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TRIM32Q13049 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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TRIM32Q13049 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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TRIM32Q13049 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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TRIM32Q13049 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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TRIM32Q13049 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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TRIM32Q13049 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
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TRIM32Q13049 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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