Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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