Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC10A2Q12908 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms