Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF5Q12774 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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