Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms