Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms