Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTBN1Q01082 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms